擬訂并組織實施發展規劃和專項建設規劃。負責機關及直屬單位的政府采購、內部審計、財務、資產管理、統計以及系統轉移支付等工作。指導監督審評、檢查、檢驗、監測能力建設，組織實施科技項目。組織貫徹實施藥品、醫療器械、化妝品創新政策和產業政策。